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Western Blot——樣品制備篇
別讓細(xì)節(jié)毀了你的實(shí)驗(yàn)!樣品制備是Western Blot實(shí)驗(yàn)的第一步,往往一個(gè)疏忽就可能讓整組數(shù)據(jù)翻車。從細(xì)胞裂解到蛋白穩(wěn)定化,每一步都藏著隱藏關(guān)卡——比如離心時(shí)的溫度、蛋白酶抑制劑的濃度,甚至樣品保存的保鮮期都可能決定成?。〗裉?,讓我們一起走進(jìn)WB實(shí)驗(yàn)的幕后,揭開(kāi)那些看似簡(jiǎn)單卻充滿挑戰(zhàn)的樣品制備奧秘!
樣品制備主要步驟
樣品制備的目的是從細(xì)胞或其他樣品中提取和溶解蛋白,去除污染物并將總蛋白濃度調(diào)節(jié)至合適的上樣范圍,主要涉及以下步驟和操作:
細(xì)胞裂解和分級(jí)分離
細(xì)胞裂解是指蛋白釋放到溶液中的過(guò)程。不同的生物材料,從不同細(xì)胞結(jié)構(gòu)分離蛋白,需要不同的裂解方法。應(yīng)使用適當(dāng)?shù)幕瘜W(xué)抑制劑并控制溫度,最大限度地降低蛋白酶和其他降解或修飾蛋白的酶活性。
溶解蛋白
要想成功的進(jìn)行PAGE電泳,必須首先將蛋白溶解到緩沖體系中??墒褂煤凶冃詣?、去污劑、還原劑、緩沖劑以及電泳體系兼容的增溶溶液。通過(guò)加入抑制劑并保持樣品低溫,防止蛋白被降解或修飾。
樣品定量
上樣前,需要通過(guò)蛋白測(cè)定法確定樣品中蛋白質(zhì)的濃度,調(diào)整濃度以進(jìn)行電泳分離。過(guò)高的上樣量會(huì)導(dǎo)致凝膠過(guò)載,過(guò)低的上樣量會(huì)導(dǎo)致條帶信號(hào)過(guò)弱。
細(xì)胞裂解常用方法
在Western Blot實(shí)驗(yàn)中,我們常常遇到不同類型樣品需要進(jìn)行蛋白的釋放,如培養(yǎng)的哺乳動(dòng)物細(xì)胞、植物細(xì)胞、組織、酵母、細(xì)菌等。下面,我們介紹幾種常見(jiàn)的細(xì)胞裂解方法。
使用除垢劑
除垢劑劑可以溶解易破裂的細(xì)胞,如血細(xì)胞或組織培養(yǎng)細(xì)胞。NP-40等非離子型除垢劑溫和且不變性,但溶解疏水蛋白能力較低。兩性離子除垢劑(如CHAPS)和離子除垢劑(如SDS)可有效增加蛋白溶解性,并使蛋白變性。
機(jī)械方法
使用勻漿器、超聲波儀或組織研磨使細(xì)胞受力破碎。超聲處理等方法會(huì)產(chǎn)生熱量,從而使樣品過(guò)熱,因此,需使用冷卻方法以避免樣品過(guò)熱。例如,在超聲處理期間,可將樣品浸入冰??;使用研缽和研杵研磨樣品時(shí),需添加液氮保持樣品低溫。通常會(huì)同時(shí)使用化學(xué)破碎法和機(jī)械法來(lái)最大限度釋放樣品中的蛋白質(zhì)。
酶處理
使用可消化植物或細(xì)菌細(xì)胞壁的酶對(duì)細(xì)胞進(jìn)行裂解處理。例如,纖維素酶和果膠酶(植物細(xì)胞)、裂解酶(酵母細(xì)胞)溶菌酶(細(xì)菌)。酶處理之后通常會(huì)再使用另一種破碎方法繼續(xù)處理,如超聲。
小技巧:無(wú)論采用何種細(xì)胞破碎方法,均應(yīng)除去所有不溶物,以免堵塞凝膠孔洞,上樣前離心(15℃下20000xg,持續(xù)15分鐘)。
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