Nanopore三代測(cè)序——能夠?qū)崿F(xiàn)核酸分子長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序

納米孔測(cè)序系統(tǒng)

　　Nanopore三代測(cè)序是新一代基于蛋白納米孔的單分子長(zhǎng)度長(zhǎng)測(cè)序技術(shù)。當(dāng)DNA/RNA鏈以穩(wěn)定的速度通過(guò)鑲嵌在電阻膜的蛋白納米孔時(shí)，不同堿基引發(fā)電流波動(dòng)產(chǎn)生特征性改變，進(jìn)而被特異性識(shí)別，用以確定DNA/RNA的堿基序列。

測(cè)序原理圖

應(yīng)用方向

		?
基因組拼接	全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組	大片段結(jié)構(gòu)變異	物種鑒定

技術(shù)優(yōu)勢(shì)

● 長(zhǎng)度長(zhǎng)

Reads可達(dá)Mb，能夠完美跨越高重復(fù)區(qū)域和高復(fù)雜區(qū)域，便于分析。

● 直接測(cè)序

直接測(cè)序原始DNA和RNA，不需要進(jìn)行PCR擴(kuò)增，避免了擴(kuò)增偏好性；保留了原始?jí)A基修飾信息。

● 實(shí)時(shí)

快速知曉樣本狀態(tài)，完成種屬鑒定。

上海柏辰已發(fā)表部分文章展示

耐藥突變測(cè)序

Zhao K, Tu C, Chen W, Liang H, Zhang W, Wang Y, Jin Y, Hu J, Sun Y, Xu J, Yu Y. Rapid Identification of Drug-Resistant Tuberculosis Genes Using Direct PCR Amplification and Oxford Nanopore Technology Sequencing [J]. Can J Infect Dis Med Microbiol, 2022, 2022:7588033.

◆ 突變檢出與一代測(cè)序相比完全一致，涵蓋更多區(qū)域。

◆ 與傳統(tǒng)藥敏試驗(yàn)相比，提前3-4周可獲知患者耐藥情況。